Юрий Иосифович Колкер родился 14.03.1946 в Ленинграде в семье инженера. В 1969 г. после окончания физико-механического факультета Ленинградского политехнического института (с отличием) стал сотрудником Агрофизического института, в 1971–1974 гг. учился в аспирантуре, до 1980 г. работал в СевНИИГиМе. В 1980–1984 гг. был кочегаром (оператором газовых котельных). С 1964 г. печатался в студенческих многотиражках, в 1972–1975 гг. – в советских литературных журналах, с 1981 г. – за границей. В 1981–1983 гг. подготовил первое комментированное издание стихов Владислава Ходасевича, разошедшееся сначала в самиздате, а в 1983 г. опубликованное в парижском издательстве La Presse Libre. Один из четырёх редакторовсоставителей антологии «Острова» (1982), представляющей
в самиздате ленинградскую неподцензурную поэзию 1950– 1980 гг. В 1982–1984 гг. был в числе первых редакторов машинописного Ленинградского еврейского альманаха (ЛЕА). В 1984 г. после многих лет ожидания получил разрешение выехать в Израиль. С 1984 г. жил в Иерусалиме, с 1989 г. живёт в Лондоне.
В 1989–2002 гг. работал на русской службе Би-би-си в Лондоне, вёл радиожурналы «В мире науки и техники», «Парадигма» и «Европа».